| Administradora de la Vía Corta Tijuana-Tecate |
| Central |
| Centro Metropolitano de Convenciones Tijuana-Rosarito-Tecate |
| Centro de Infraestructura y Desarrollo para Comunidades Rurales |
| Colegio de Bachilleres de Baja California |
| Colegio de Educación Profesional Técnica de Baja California |
| Colegio de Estudios Científicos y Tecnológicos del Estado |
| Comisión Estatal de Energía |
| Comisión Estatal de Servicios Públicos de Ensenada |
| Comisión Estatal de Servicios Públicos de Mexicali |
| Comisión Estatal de Servicios Públicos de Tecate |
| Comisión Estatal de Servicios Públicos de Tijuana |
| Comisión Estatal del Agua |
| Comisión de Arbitraje Médico del Estado |
| Comité de Planeación para el Desarrollo del Estado |
| Dirección del Registro Público de la Propiedad y de Comercio |
| Fid. Púb. de Admón. de Fondos e Inversión de Carretera Cent-Rum |
| Fideicomiso Fondo de Garantías Complementarias y Créditos Puente |
| Fideicomiso Público para la Promoción Turística de Baja California |
| Instituto de Crédito y Apoyos Educativos |
| Instituto de Cultura de Baja California |
| Instituto de Psiquiatría del Estado de Baja California |
| Instituto de Seguridad y Servicios Sociales de los Trabajadores del Gobierno y Municipios del Estado de Baja California |
| Instituto de Servicios Educativos y Pedagógicos |
| Instituto de Servicios de Salud Pública |
| Instituto de la Infraestructura Física Educativa |
| Instituto de la Juventud |
| Instituto de la Mujer |
| Instituto del Deporte y la Cultura Física |
| Instituto para el Desarrollo Inmobiliario y de la Vivienda |
| Junta de Urbanización del Estado de Baja California |
| Oficialía Mayor de Gobierno |
| Oficina del Titular del Ejecutivo |
| Paraestatal |
| Poder ejecutivo |
| Procuraduría General de Justicia del Estado |
| Régimen de Protección Social en Salud |
| Secretaría General de Gobierno |
| Secretaría de Desarrollo Agropecuario |
| Secretaría de Desarrollo Económico |
| Secretaría de Desarrollo Social |
| Secretaría de Educación y Bienestar Social |
| Secretaría de Infraestructura y Desarrollo Urbano del Estado |
| Secretaría de Pesca y Acuacultura |
| Secretaría de Planeación y Finanzas |
| Secretaría de Protección al Ambiente |
| Secretaría de Salud |
| Secretaría de Seguridad Pública |
| Secretaría de Turismo |
| Secretaría de la Contraloría y Transparencia Gubernamental |
| Secretaría del Trabajo y Previsión Social |
| Sistema para el Desarrollo Integral de la Familia |
| UCT Administrador |
| Unidad de Especialidades Médicas |
| Universidad Politécnica de Baja California |
| Universidad Tecnológica de Tijuana |
